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Title: 2-chlorovinyl tellurium dihalides, (p-tol)Te[C(H)=C(Cl)Ph]X2 for X = Cl, Br and I: variable coordination environments, supramolecular structures and docking studies in cathepsin B
Authors: Caracelli, Ignez
Zukerman-Schpector, Julio
Maganhi, Stella H
Stefani, Hélio A
Guadagnin, Rafael Carlos [UNIFESP]
Tiekink, Edward R. T
Universidade Federal de São Carlos Departamento de Física
Universidade Federal de São Carlos Departamento de Química Laboratório de Cristalografia, Estereodinâmica e Modelagem Molecular
Universidade de São Paulo (USP)
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
University of Malaya Department of Chemistry
Keywords: organotellurium-dihalides
docking studies
cathepsin B
crystal structures
supramolecular arrangements
Issue Date: 1-Jan-2010
Publisher: Sociedade Brasileira de Química
Citation: Journal of the Brazilian Chemical Society. Sociedade Brasileira de Química, v. 21, n. 11, p. 2155-2163, 2010.
Abstract: Crystallography shows that the Te atom in each of (p-tol)Te[C(H)=C(Cl)Ph]X2, for X = Cl (1), Br (2) and I (3), is within a distorted Ψ-pentagonal bipyramidal geometry. An E configuration for the vinyl group in (1) precludes the formation of an intramolecular Te···Cl interaction so that an intramolecular Te···π interaction is found instead. The coordination environment features a linear Cl-Te-Cl arrangement with the pentagonal plane defined by the two C atoms of the organic substituents, an intermolecular Te···Cl contact, a Te···π interaction and a stereochemically active lone pair of electrons. In the X = Br (2) and I (3) structures, similar coordination geometries are found but the Te···π contact is replaced by an intramolecular Te···Cl contact owing to the adoption of a Z configuration about the vinyl bond. The differences in structure are readily explained in terms of electronic effects. Docking studies of cathepsin B with (1')-(3'), i.e. 1-3 less one Te-bound halide, show efficient binding through the agency of covalent Te-S Cys29 bonds with stabilization afforded by a combination of N-H···π, C-H···π and Cl vinyl···H interactions. These results comparable favorably with known inhibitors of cathepsin B suggesting the title compounds have potential biological activity.
Os estudos cristalográficos mostram que o poliedro de coordenação ao redor do átomo de Te, em cada um dos compostos (p-tol)Te[C(H)=C(Cl)Ph]X2, com X = Cl (1), Br (2) e I (3), é uma Ψ-bipirâmide pentagonal distorcida. O grupo vinil em (1) adota uma configuração E o que impede a formação de uma interação intramolecular Te···Cl e em seu lugar é encontrada uma interação intramolecular Te···π. O poliedro de coordenação é formado por um arranjo linear Cl-Te-Cl com o plano pentagonal definido por dois átomos de C dos substituintes orgânicos, um contato intermolecular Te···Cl, uma interação Te···π e um par isolado de elétrons estereoquimicamente ativo. Geometrias de coordenação semelhantes são encontradas para as estruturas com X = Br (2) e I (3), mas a interação π é substituída por uma interação intramolecular Te···Cl devido à adoção de uma configuração Z em torno da ligação vinil. As diferenças nas estruturas são facilmente explicadas em termos de efeitos eletrônicos. Estudos de docking em catepsina B com (1')-(3'), ou seja, compostos 1 a 3 em que há um haleto a menos ligado ao átomo de Te, mostram que há uma ligação eficiente com a proteína pela formação da ligação covalente Te-S Cys29 com a estabilização proporcionada por uma combinação de interações N-H···π, C-H···π e Cl vinyl···H. Estes resultados são comparáveis aos obtidos com inibidores conhecidos da catepsina B o que sugere que os compostos estudados têm potencial atividade biológica.
URI: http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/5472
ISSN: 0103-5053
Other Identifiers: http://dx.doi.org/10.1590/S0103-50532010001100018
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