Functionomics: the analysis of a postgenomic concept on the basis of pregenomic pharmacological studies in smooth muscle

Functionomics: the analysis of a postgenomic concept on the basis of pregenomic pharmacological studies in smooth muscle

Author Jurkiewicz, Aron Autor UNIFESP Google Scholar
Caricati-Neto, Afonso Autor UNIFESP Google Scholar
Jurkiewicz, Neide Hyppolito Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Abstract The term functionomics (Amin 2003, Neumann et al. 2004) refers to a postgenomic integrated Systems Biology (Attur et al. 2002) using a multidimensional approach for cells, tissues and organs. It considers current or future involvement among genomics, proteomics or metabolomics, including the main factors that cause biological responses and modulation under different conditions. Our objective in the present review is to summarize the contemporary understanding of functionomics of smooth muscle pharmacology, based on the results obtained on the pregenomic era during several years in our laboratory. The present approach is based on the knowledge of the dynamics of the receptor system, which comprises a cascade of phenomena, leading from the drug administration to the final biological response. We will describe several conditions in which the final effect is modified, based on perturbations induced on drug absorption, distribution, metabolism, interaction with receptors and mobilization of second messengers, as well as by interactions with a second receptor system. We will also discuss the gaps that need to be fulfilled in order to obtain a clear and better understanding of the receptor system in smooth muscle, and to narrow the bridge between ourknowledge of the function of biological systems, genomics, and other recently introduced areas.

O termo funcionômica (Amin 2003, Neumann et al. 2004) refere-se a um estudo posgenômico de Biologia de Sistemas (Attur et al. 2002), usando um enfoque multidimensional, dinâmico e simultâneo para células, tecidos e órgãos. Considera o envolvimento presente e futuro da genômica, proteômica e metabolômica incluindo os principais fatores que causam a resposta biológica final e sua modulação em diferentes condições. Nosso objetivo na presente revisão é resumir o nosso conhecimento atual em relação à funcionômica da farmacologia da musculatura lisa, baseada em resultados que obtivemos ainda na era pregenômica, durante vários anos em nosso laboratório. O presente enfoque baseia-se no que sabemos hoje em dia sobre a dinâmica do sistema receptor, que compreende uma cascata de fenômenos, que vão desde a administração de uma droga até a resposta biológica. Descreveremos várias condições nas quais a resposta é modificada, com base em perturbações produzidas na absorção, distribuição e metabolismo de fármacos, interação com receptores, mobilização de segundos mensageiros, bem como interações com um segundo sistema receptor. Discutiremos também o papel da genômica e as inúmeras falhas que devem ser preenchidas, para que se chegue a um conhecimento integrado e cada vez melhor dos sistemas receptores na musculatura lisa e para encurtar a ponte entre as funções do sistema biológico, genômica e outras áreas recentemente introduzidas.
Keywords functionomics
receptor
smooth muscle
genomic
funcionômica
receptor
musculatura lisa
genômica
Language English
Date 2009-09-01
Published in Anais da Academia Brasileira de Ciências. Academia Brasileira de Ciências, v. 81, n. 3, p. 605-613, 2009.
ISSN 0001-3765 (Sherpa/Romeo, impact factor)
Publisher Academia Brasileira de Ciências
Extent 605-613
Origin http://dx.doi.org/10.1590/S0001-37652009000300022
Access rights Open access Open Access
Type Article
Web of Science ID WOS:000269462300022
SciELO ID S0001-37652009000300022 (statistics in SciELO)
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/5219

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